לאחר הובלת השסתום למחסן, על האפוטרופוס לעבור את הליכי האחסון בזמן, דבר המסייע לבדיקה ואחסון של השסתום. על האפוטרופוס לבדוק היטב את סוג ומפרט השסתום, לבדוק את איכות מראה השסתום ולסייע למפקח בבדיקת חוזק ובדיקת אטימות של השסתום לפני האחסון. שסתומים העומדים בקריטריוני הקבלה יכולים לעבור את הליכי האחסון; אלה שאינם מוסמכים צריכים גם להישמר כראוי לסילוק על ידי המחלקות הרלוונטיות.
עבור השסתומים במחסן, נגב ונקה בזהירות את המים, האבק והלכלוך במהלך הובלת השסתום; יש למרוח שכבה של חומר נגד חלודה או להדביק שכבה על משטח העיבוד, גזע השסתום ומשטח האיטום הנוטה לחלודה. הגן עליו עם נייר עמיד בפני חלודה; אטום את כניסת השסתום והיציאה באמצעות כיסוי פלסטיק או נייר שעווה כדי למנוע כניסת לכלוך.
שסתומי מלאי צריכים להיות עקביים עם החשבונות שלהם, מסווגים לקטגוריות, ממוקמים בצורה מסודרת, מסומנים בבירור וניתנים לזיהוי בקלות. שסתומים קטנים צריכים להיות מסודרים על המדף לפי סדר מפרטי הדגם והגדלים; ניתן לסדר שסתומים גדולים על רצפת המחסן ולהציב אותם בבלוקים לפי מפרט הדגם. שסתומים צריכים להיות ממוקמים זקוף או באלכסון. אל תיגע במשטח איטום האוגן לקרקע, שלא לדבר על ערימת אותם יחד. לשסתומים גדולים במיוחד ושסתומים שאינם ניתנים לאחסון באופן זמני, יש להציבם זקופים גם במקום חיצוני יבש ומאוורר לפי הקטגוריה והגודל שלהם; יש להגן על משטח האיטום של השסתום בשמן ולאטום את המעבר; לארגז המלית ללא אריזה, על מנת למנוע גשם בכניסה לשסתום יש לאטום את פתח הארגז בשומן כגון חמאה ולכסות אותו בלינוליאום או בד גשם. עדיף להקים מחסן אחסון זמני כדי להגן עליו.
על מנת לשמור על תקינות השסתומים, בנוסף למחסן יבש, מאוורר, נקי ונטול אבק, צריכה להיות גם מערכת ניהול מתקדמת ומדעית; יש לתחזק ולבדוק את כל השסתומים באחסון באופן קבוע, בדרך כלל מהיום שהם עוזבים את המפעל. לאחר 18 חודשים יש לבדוק מחדש את בדיקת הלחץ.
עבור שסתומים שלא נעשה בהם שימוש זמן רב, אם נעשה שימוש באריזת אסבסט, יש להוציא את אריזת האסבסט מתוך קופסת המילוי כדי למנוע קורוזיה אלקטרוכימית ונזק לגזע השסתום. עבור שסתומים ללא אריזה, היצרן מצויד בדרך כלל באריזה רזרבית, ועל האפוטרופוס לטפל בה כראוי.
חלקי שסתומים שניזוקו או אבדו במהלך ההובלה, כגון גלגלי יד, ידיות, סרגלים וכו', צריכים להיות מסופקים בזמן ואסור להחמיץ.
יש להחליף או להוסיף חומרי סיכה וחומרי סיכה נגד חלודה החורגים מתקופת השימוש שנקבעה באופן קבוע בהתאם לתקנות.
